几天的改造之后，尽管有三百多人因为受不了而退出，但剩下的士兵的精神况态都得到了明显的改观，虽然绝大多数人还达不到成为正式士兵的技能标准，但在训练之余，也可以和辅兵一起做一些辅助性的工作了。同时还有更多的明军也都愿意加入商家军来。因此现在商家军里，像这样明军数量以经达到一千八百多人。对此商毅仍然是和原来一样，来者不拒，但必须受接受商家军的改造训练。并且也正试给他们命名为商家军预备队。
在前一阶段的战斗中，商家军同计阵亡了三百一十七名士兵，商毅见前一阶段对旧明军的改造效果还不错，因此也进行了一次选拔比赛，将一批训练成绩优绣的明军补充进商家军来，正式成为商家军的一员。
为此商毅还正式招开了一个欢迎新兵加入商家军的大会，不仅使这些明军十分激动，而且对其他预备队的士兵来说，也是一个很大的鼓励：商毅说话是算数的，只要认真训练，尊守纪律，达到标准，就可以正式为选拔进入商家军。因此训练也就更加认真刻苦了。
而击败李自成的战斗中，商家军又抓到了不少俘虏，现在俘虏总数以经接近四千多人，对俘虏的管理办法还是和以前一样，用积分等级制度的划分管理，因为有了前一阶段的经验