的控制权曾经过了数年的激烈争夺。
结果双方互有胜负，郑芝龙虽然稍占上风，但也不愿长期树敌，因此最后双方不得不互相都退让一步，郑芝龙退出台湾，让给荷兰人，同时荷兰人承认郑芝龙在中国沿海的控制权，不追求在福建进行贸易，而且双方同意进行贸易往来。荷兰保留通向马尼拉和巴达维亚的航线。但荷兰的对日本贸易，需经郑芝龙将中国特产运至台湾，转手之后，方由荷兰方面运往日本出售。
商毅也曾有过与郑芝龙联合对付荷兰人的想法，但郑芝龙也未必肯甘心，在联手击败了荷兰人之后，再将台湾这样一战略要地与商毅共同分享，螳螂捕蝉，还要预防黄雀在后，联合也是要以实力为基础的，关建还是在于商家军的海上实力太差了。不足以让郑芝龙和荷兰人感到畏惧。
相反，暂时把荷兰人留在台湾，并且与荷兰人达成一些合住协议，一方面可以稳定住商家军在台湾的统治基础，另一方面也能牵制住中国沿海的郑芝龙集团。因为如果商毅要发展海外贸步，早晚都会和郑芝龙发生冲突，而荷兰人是唯一能在中国沿海进行贸易的非郑氏集团船队，因此把目前的两雄争霸渐渐变成三国演义，借助荷兰人的力量打破郑芝龙的陇断地位，这才是当前最好的选择。