人也没有伤筋动骨，而明军就己经捉襟见肘了，在这种情况下，一些意志不坚定的明军也开始动摇，寿州原来的守将总兵张天禄、张天福兄弟带着近两千人，投降了淸军也使淮河防线出现了一个大缺口，耿仲明也趁机发动进攻，一举攻破了淮河防线，然后直扑寿州。
而这时刘肇基手里的兵力己不足二千，根本就守不住寿州，只好向东南撤退，耿仲明也趁势占领了寿州。
虽然只是淮河上游被突破，但也意味着清军有了一个突破口，淮河防线己告守，因此多铎也下令，命进攻泗州的孔有德分兵牵制住怀远和五河的商家军，而自己率领大军，转道从寿州渡河，然后汇合耿仲明的人马，沿淮河南岸东进，进攻凤阳。