史可法，如果商毅接任了督师的职位，史可法怎么办，那就只能回南京入阁理事了，不是还有人要自己主动辞职让位吗？史可法一入阁，不就正好可以接任首辅吗？
这点小把戏那能瞒得过马士英呢？因此马士英对东林党又轩起的这一阵呼声装作没听见。相反还以保卫南京为名下令，让黄得功驻守芜湖，让刘良佐驻守无为州，并不返回他们先前的驻地。
同时马士英又上疏南京朝廷，要求朝廷招降李自成，封李自成为顺国公，驻守湖广，接挡清军的进攻。这一个决定顿时又是一石激起千层浪，因为李自成是害死先帝的罪魁祸首，马士英居然竟冒天下之大不违，提出招降李自成，自然立刻又遭到了东林党的一阵口诛笔伐。
但马士英丝毫也不为所动，坚持向李自成派出了使者。