也随着多铎回京面见多尔衮。尽管这次南征并没有达到扫淸江南的目地，但到目前为止，清廷控制的地区大体包括了整了北方地区，除山东半岛以外的全部地方，而在南方，清军还占据了湖广北部，和淮河以北的地域，大体比当年金宋对持时的金国地盘要略大一些，另外东西的两个战略要点，襄阳和徐州都在清军的手里，也保持着对南方的战略主动权，因此其实来说，这一次进军也并不算完全失败，至少清廷己在中原站稳了脚，占领了半壁江山。
但在这一次南征中，清军的伤亡极大，加上前期争夺山东的战争，清军共计损失的兵力达二十五万左右，虽然其中大部份是明朝的降军，但满八旗兵的损失也不算小，约为二万七八千人，超过满旗总计兵力的四分之一以上，汉军的损失也超过了五万人，随军的包衣跟役也有六七万人。这在清廷自太祖努尔哈赤起事以来，可是前所未有的重大损失。
尽管现在多尔衮己权倾朝野，没有人敢当面问责他，但这样的重大损失，自然要有人付责，多铎虽然是多尔衮的心腹，但也被多尔衮降为郡王，而被多尔衮寄于了厚望的洪承畴，这次南行也沒有力挽狂澜于不倒，则被除去所有官职，只保留一个大学士向虚号，而洪承畴也索性告病，回到在北京郊外购置