弘光元年(年)，十二月十八日。面临着清军咄咄逼人的攻势，一直躲在后宫里享乐，久未理事的皇帝朱由崧也终坐不住了，下旨升朝，招集文武官员，商议应付淸军的进攻。
说实话也沒有什么好商议的了, 因为现在谁都知道，整个南方只有商家军能够抵挡得住清军的进攻，只有把商家军调入南京来驻守，才是保住南京的唯一方法。因此朝会的目地只有一条，就是说服目前执政的东林党派系同意，调商毅出兵，戎卫南京。
其实现在执政的钱谦益、黄宗羲还有候恂、四公子等人心里也都清楚这一点，包括在他们內部，也有人提议过，调商毅出兵。但在这一段时间以来，商毅不仅在［杭州时报］上连续发表攻击东林党的文章，而且还连上了三份正式的奏折到南京朝中，不仅要求朝廷罢免钱谦益、黄宗羲等人，重新启用史可法和吴甡，甚致暗示东林党现在己经把持了朝纲，架空了皇帝，因此只要朝廷下旨，自己可以带兵进京，清君则。大有和东林势不两立的意思。
在这样的情况下，钱谦益、黄宗羲等人当然不敢调商毅进南京了，候方域甚致表示，一但调商毅入京，东林党人将会重复天启年的惨剧，死无葬身之地，因此宁可熬到清军兵临城下，设法与清军讲和，