在正常时期，紫明楼可以在南京的权贵之中左右逢源，大家互相牵制，沒有一个实力突出的，结果达成了一个微妙的平衡。而现在是非常时期，这个平衡早就不存在了，而商家军在南京城里，却有绝对实力。
因此经过了抄查，果然被商家军搜出了大量的证据，仅仅是与清廷的通信，就搜出了达到一百多封，另外还有大量的名册，文件、武器，地图、伪装物品等等。因为墨经纬下令不许反抗，不许泄漏身份，因此除了紫明楼的招牌名妓紫玲珑因外出逃脱之外，其他的掌柜、帐房、妓女、从人、护院等等人员，也都全部被抓获，一共是一百三十七人。
同时在另外一间房屋里，还发现了一条地道，但地道的出口，是几条街外的一间普通小屋，但等商家军的人员钻出地道以后才发现, 这里己人去屋空,被全部转移，因此追查的线索也全部断了，不能判断是否有人从地道逃走。付责查抄紫明楼的段鹏也只好下令，将搜找到的证据，还有抓获的人员全部都押回军营去，慢慢的审问。
商家军公然查抄紫明楼，确实在南京又引起了一场轩然大波，因为紫明楼在南京的权贵之中，确实有十分特殊的地位，也有不少人对商家军的举动非常不满，甚致还在朝廷上提出了弹亥。但商毅公布