这个时候，从杭州派遣到南京来的一百多名行政管理人员都己经到位，并且都开始了自己的工作，有了这一批人员的加入之后，再加上商家军在南京城维持治安，并且提供生活物资，南京的秩序也都己经完全恢复了正常，一些逃亡在外和南京周边地区的人员也都搬进了南京城里居住，也使南京城里的人口增加到十六七万左右，并且而且正在进行着户藉登记造册工作。
因此等商毅和李岩回到南京之后，南京城里己经恢复了几分过去的元气，一些买卖商铺都开始开门营业，在街上也有不少的行人的踪影。还有不少的房屋也正在重新修建中，秦淮河畔也有两家酒楼开张，战争之后的痕迹也在慢慢清理消除之中。
现在离商家军收复南京，才不到一个月的时间，南京就能够恢复成这个样孑，也让商毅觉得很满意。
商毅刚一回到南京，又连续收到两条消息，首先是在凤阳驻守的洪承畴接到了清廷的调令，返回北京去接受清廷的处置。另一条是两支跨海突袭部队都己经平安的撤回到山东登州。其中付责突袭京津地区的第二分舰队将留在登州，保证可以随时从海上打击清廷的力量，迫使清廷必须在渤海沿岸，以及辽东地区保留大量的驻军设防，在短时间内，难以向南方战场