辉元之子毛利秀就。虽然他也很想幕府倒台，但现在的情况，他也知道自己无力抵拒幕府，因此在接令之后，毛利秀就也立刻行动，组织人马，调集战船，准备这场战争。
虽然幕府实行闭关锁国的政策，但甴于日本本身是一个岛国，内部的航行依然十分发达，因此长州藩仍然保留了一支水军。不过想运送六万大军，可不是一个小数目，仅靠长州藩的战船是不够的，还需要调集其他大名的船只，但这时的日本己经久无战事，最后一次大规模用兵，也是在十年前的岛原之乱，兵马、战船的组织、调配都十分生疏。结果在先锋船队出发之后，大队人马还有诸多事情。
而就在这时，从琉球逃回来的船只向毛利秀就报告，日本船队遭到中国水军的袭击，这时到达琉球的日本战船己经全军覆没了。
毛利秀就听了之后，也不由大惊失色，虽然在上一次萨摩藩惨败给商家军之后，他也知道商家军的水军巨舰重炮，十分厉害，但毕竟没有交过手，也不知道是俱体怎么个厉害法，但也没想到这次派出的一百多艘战船竟全军覆没了。那么这样一来，留在琉球岛上的萨摩、彦根两藩的人马皆不是就成了孤军了吗？由其是彦根藩，可是徳川幕府的老臣，如果在琉球岛上有个意外，自己可担不起