有动身的原因是，商毅决定这次出兵，将由自己亲自带队出战。
这个决议也遭到四名内阁成员的全体反队，虽然他们都赞同出兵马尼拉，保护海外华人，但都不赞同商毅亲自出马，因为商毅是南京政府的主心骨，说白了就是南京政府的皇帝，当然不可轻易出动，万一商毅离开南京，清廷再度发动南侵又该如何应付。而且海上不同于陆地，万一遭受风浪凶险，后果实在是不堪设想。因此就像去年对琉球、曰本的一样，派一员大将带队就可以了。
不过商毅仍然坚持己见，认为这些理由都不充足，过去商毅也经常出征在外，由叶瑶瑱在家里坐镇，代理政务的模式，己经有相当的经验了。而从情报机构发回的消息来看，清廷內部的矛盾也有很多，现在跟本没有能力发动大规模的南侵，而且现在南京政府的五大军区全部都齐备，在南京还有统战部，一般的局部战争完全可以应付得了。
而海上的风浪，属于天险，谁都没有办法预料，海军成立了这么多年，出海作战也不是一回二回，但因风浪而发生减员的事情并不多。因为现在的造船技术已经发展到一个很高的水平，而且菲律宾离台湾并不远，也就和到琉球差不多，而且在途中还有不少的小岛，一但遇到风浪，完全可以及时停靠