先头船队是在六月上旬从杭州出发, 前往马尼拉。
按照正常的航速，从杭州到马尼拉需要十五天左右的时间，但现在是六月，也就是公历的七月底，风向多以东南风为主，少有西北风，因此船队在多数时侯都是逆风而行，虽然到了这个时代，风帆船的技术己经十分发达，可以通过不断转换风帆的角度，在逆风的情况下，也能航行，但速度明显就要慢了许多，而且需要付出大批的人力，仅靠船上的水手，很难让船保持连续的逆风航行。
不过现在船上装着都是士兵，人力是不成问题，在沿途也遇到了十余艘从马尼拉返航的商船，得知马尼拉的局势进一步紧张起来。因此在逆风的情况下，船队仍然向菲律宾航行。但就是这样，等船队到达菲律宾的时侯，也用去了二十天的时间。
菲律宾是一个群岛之国，共计约有七千多个岛屿，不过现在有人定居的岛屿只有二三十个，主要的大岛有十三个，以北部的吕宋岛最大，东南部的棉兰老岛其次，加上西南的巴立望岛，正好构成一个呈南北走向，北尖南宽的三角形。
吕宋岛位于菲律宾群岛北部，三角形的尖瑞，总面积和浙江省相等，都是十万平方公里左右，占菲律宾群岛总面积的三成以上，大体呈一个南