其实攻占马尼拉城，击败西班牙殖民者并不难，主要是商毅打箅在马尼拉长期占领，把马尼拉成为中国的殖民地，因此在占领马尼拉之后，善好的事情也是千头万绪，十分复杂，这也是商毅坚持要自己带兵出征的一个重要原因，成钢和黄震在这方面还嫩了一点。
商毅首先宣布，菲律宾这个名字正式取消，以后全部都以“吕宋”为这一地区的称名，菲律宾群岛也改名为吕宋群岛。而圣地亚哥堡，改名为镇南堡。不过其他各岛屿的名称和马尼拉城的名字保持不变。虽然说名字只是一个代号，但仍然十分重要，菲律宾全面改名为吕宋，也标志着这一片岛屿的主权正式发生了变更。
当然名称的改变只是一种像征意义，吕宋地区的最大作用，还是在于作为欧州和美州地区通向中国的一个贸易中转站，尽管它距离中国大陆的路程只有十五到二十天的距离，但依然是一个重要的商品集散地和中途的补济点。用后世的话来说，是一个物流集散中心。
商毅占领马尼拉，不仅仅是看重了吕宋地区的地理优势，同样还有吕宋地区的自然资源，吕宋地的铜矿十分丰富，也有相当的铁矿和金矿储量，这些都是前商毅正需要的金属矿产。另外吕宋群岛属于亚热带地区，不仅森林资源丰富