和尚可喜联起手来，从商毅的背后发动进攻，牵制商毅的兵力。另外在清廷的水军遭受毁灭性打击之后，多尔衮也更加认识到水军的重要性，招降郑成功，也还可以使清廷立刻就拥有一支强大的水军力量。
因此尽管多尔衮也清楚，利用郑芝龙来诱降郑成功的把握并不大，但也不愿意放弃一丝的机会，反正郑芝龙在自己手呈攥着，随时都可以杀他，也不用怕他跑了，留着郑芝龙，总归还有一线的希望。
另一方面，现在北京的动乱虽然己经平复下来，无论是强迫也好，自愿也好，总归也开饴有一部份百姓又回到了北京安居，但汉人对满人的敌视情绪依然很重，由其有不少汉官降将，对清廷的态度十分不信任，因此也仍然需要继续缓和满汉矛盾，而郑芝龙也属于降将中的一员，如果冒然将郑芝龙杀了，恐怕对那些降将中，引发一个不好的信号。现在的局面下，留下郑芝龙，确实要比杀了他好。
不杀郑芝龙的决定很容易做出，但如何应对中华军的进攻，却让多尓衮头痛不己，这一次中华军是从水路发起的攻击，虽然清军损失不小，但中华军最终还是退回去了，但下一次中华军如果从陆地发动进攻，可就不会这么轻易退兵了，因此多尔衮也意识到，仅靠清廷的力量，很难和中