正好就在这时，郑成功的上疏送到了南京，商毅突然意识到，郑成功到是最合适的人选，因为这四个条件他都俱备，郑成功本来就是一支独立的政治势力，俱有很强的军事和行政管理能力，也不乏海洋意识，虽然在对海外事务和经商方面要略差一点，但并不是完全不懂，而且他还有一个老头子郑芝龙，完全可以弥补郑成功这方面的不足。而且更为重要的是，郑成功手底下还有一个比较完善的班底，因此让他去完成这个开拓中国历史上第一个海外殖民地的使命，自然是再合适也不过了。
而且商毅也知道郑成功但心什么，因为和其他的降将不同，郑成功不仅有自己的班底，还受过明朝的赐姓，以前一度以国姓爷自居，在新朝当中，这当然是很受忌讳的事情，因此郑成功不敢在新朝为官，也不是没有原因的。但中国西印度公司总督这个职位，介于半官半商之间，最重要的是居于海外，山高皇帝远，谁也管不着。郑成功也能够安心。
另外商毅对郑成功多少也有一些愧疚感，因为在另一时空里，郑成功可是中国著名的民族英雄，內御清军，外收台湾，功绩赫赫，青史留名。但现在这些历史功绩都被自己给剥夺了，郑成功的抗清事迹基本成了打酱油，而收复台湾的功绩更是一点都没捞着