在第三代风影失踪后，砂隐与木叶之间的摩擦不断，最终在一次摩擦中双方不再克制，第三次忍界大战正式开打。同时岩隐村也加入战团与云隐村正式开战。此刻的五大国也就保持封闭状态的雾隐村暂时还没有被卷入战争。
战争一开始交战各方就陷入了僵持状态。与砂隐的前线对峙方面，木叶方面派出木叶三忍之一的自来也率领援军支援，木叶一方开始占据上风。砂隐村方面也随即向前线增兵，在日后的第四代风影的罗砂率领援军抵达后，双方再度陷入僵持。
战争进行了6个月后，战局又发生了新的变化。雾隐与砂隐开战了，双方将战场放在了川之国。在这场战争中，砂隐村的灼遁忍者叶仓靠着一己之力将雾隐村打的节节败退。木叶看准时机，企图在另一侧战线打破僵局，长老会决定由大蛇丸率领一部精锐忍者进攻雾隐。
同一时期，岩隐的一支小队在草之国遭遇木叶忍者，双方爆发激烈冲突，具体缘由不详，最终双方互相宣战。至此，第三次忍界大战进入高潮，各个大国纷纷投入这新的一轮征战厮杀中去。
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半夜，草千琉羽醒来。醒来的她感觉自己浑身上下各种酸疼，整个人都散架了。环顾四周，确认是在