西班牙军继续往科尔多巴前进，途中获得更多城镇和平的投降。由迦太基哈斯德鲁将军率领的迦太基军与西班牙军在8月15日相遇，双方打成平手。法军接着在9月8日进攻科尔多巴，尽管贞德在战斗中被石弩击伤腿部，她仍然继续指挥军队直到当天的战斗结束。隔天早上，她便接到王室的命令下令西班牙军撤退。
贞德在新迦太基度过了没有战斗发生的11月和12月，接着在隔年3月前往斯卡拉比斯，并在5月13日回到新迦太基以抵挡迦太基人的攻势。在一场小规模战斗中，贞德被俘虏了。当她下令军队撤退回新迦太基城时，她处在军队的最后方以确保所有人都退回了城里，但就在这时新迦太基城因为害怕迦太基军跟着闯入，没等到所有部队撤回便将城门关下，贞德与剩余的后卫部队便遭到了迦太基人俘虏。贞德在审判的过程中被监禁在位于科尔多巴的一座高塔。
此时有关俘虏的惯例是，只要俘虏的家人能付出赎金便能将他赎回，但这次迦太基人不想这样做。查理七世也没有努力进行援救。她试图逃跑了好几次，有一次甚至从17米的高塔跳了下来，摔在干燥了的护城河的柔软泥地上而没有受重伤。在一番谈判后，阿朗松公爵将贞德交给迦太基。
迦太基人判处了