危机》的正代游戏，并借鉴了一些电影元素。
游戏的环境位于一九九八年九月份的浣熊市，也就是游戏中一代和二代之间，电影第二部开始之前。
一代游戏男主角克里斯-雷德菲尔德，女主角吉尔-瓦伦丁刚刚调查完“洋馆”事件，将调查到的信息上报给了浣熊市警察局。但是不但报告被压了下来，他们两个也被勒令强制休假，他们只能分头展开调查。
二代游戏男主角里昂-斯考特-肯尼迪作为警校刚刚毕业的新人，赶来浣熊市警察局报道。女主角克莱尔-雷德菲尔德也来到浣熊市警察局寻找自己失踪了的哥哥，也就是一代游戏男主角克里斯。
电影女主角爱丽丝被强制加入了复仇天使计划，被注入了t病毒，放到浣熊市医院中观察。
但是此时保护伞公司位于地下的研究所出现了事故，导致t病毒泄露，已经感染了浣熊市的市民。
接下来的几天之内，感染将会呈几何级数扩展。最终，政府为了消灭t病毒，只能对浣熊市进行封锁，并用原子弹核平整座城市。
吉尔因为留在了浣熊市进行调查，被封锁在了城市当中。里昂、克莱尔、爱丽丝也因为不同的原因，被困在了浣熊市的各地。