裁判所内部的职能分工是这样的，除了教宗掌管绝对权力之外，第二和第三审判长负责对异端的裁决以及解决教会的各项隐患，说白了，他们负责裁判所的武力。
除了两位审判长之外，还有五位书记长。
书记长是负责情报方面的事宜，散布在世界各地的暗探都是由五位书记长掌管，每日里有大量的情报会传递到阿尔吉斯，由五位书记长筛选。
基本上，这七个人加上教宗，就构成了裁判所的权力中心。
而在这七个人之外，也有负责装备、训练、后勤等部门的官员，但是他们的地位要比七人低一头，分别由七人统属。
再往下，就是裁判所的审判员了。这些人是裁判所的基层，为数众多，不过内部也会有等级划分，分别是初级审判员，中级审判员和高级审判员。
实力也从学徒级到大巫师不等，在这之外，还有招收一些编外人员。编外人员的身份和实力不固定，有最寻常的普通人，也有虔城的信众，甚至还有一些实力强大的巫师或者骑士。
这些人都是跟裁判所保持着合作，在需要的事情提供情报、金钱或者武力，这些人的身份是需要绝对保密的，没有任何一个审判长或者书记长知道所有的人，