可以说说是极为融洽，只是后来大敌渐灭，人族、妖族逐渐繁衍，为了争夺生存空间屡次爆发冲突，这才导致神农与女娲离心，最后形同陌路。
只是伏羲所属的神族因为人口稀少，本身又无法繁衍，所以与妖、人两族一直没什么冲突。伏羲和神农的关系一直就不错，比起身为女性，在很多方面有着不同要求的女娲还要强出不少。而且因为外貌、寿元的差异，神族也跟妖族有更多的相似之处，至少当时人族是无法将长翅膀、长羽毛的那些神族看做是自己的同胞的，而妖族则无所谓，因此在三族九泉大战真正开始之前，无论是神农还是妖族都以为神族会站在自己一边的，到时候两族联手将那些孱弱的人族拿下，简直就是轻而易举的事情，神农甚至都想好以后与伏羲一个管天一个管地，神、妖两族永不侵犯了。
谁曾想最后伏羲和他的神族却在背后捅了神农一刀，不仅伏羲亲自上阵，趁神农孕育完子嗣，元气未复的时候，联合女娲一起将后者封印，就连神族也下场拉偏架，以九天玄女为首的神将帮助人皇轩辕生生逼死了蚩尤，要知道那可是神农废了好大力气才培育出来，继承他血脉之力最多的后裔，结果刚成年不久就死掉了，这一结果简直让神农痛彻心扉。
可以说比起一直