清军在太社稷和太庙里虽然也布置了一部份兵力守卫，但在这个时候，谁都知道大势己去，没有再继续战斗下去的勇气了，在守卫承天门的军队向紫禁城里退却的时候，也都跟着一起撤退，但有相当一部份清军向商家军投降。
投降的清军基本都是清军入关之后收纳的降兵，虽然付责守卫太社稷和太庙的清军将领还想阻拦，但一来是投降的清军实在太多，想拦也拦不住，二来商家军已经攻了进来，也不容他们在太社稷和太庙里久耽误，结果也只好对投降的清兵放任不管，带着沒有投降的清兵退进了紫禁城里去驻守。
苏建林一面命人收容降兵，一面指挥着军队，继续向紫禁城的午门发动猛攻。但紫禁城是清军最后的阵地了，因此清军也进行了拼死的抵抗，而且守卫紫禁城的，都是清军中战斗力最强的满汉旗军，多铎也亲自持刀督战，清军也是人人拼命。战斗也进行得十分激烈，清兵们乎完全是奋不顾身，对商家军的进攻不躲不闪，不招不架，而是对砍对刺，不少人在中刀中枪之后，依然还死战不退，甚致用牙咬，用石头猛砸等等招术，也全都用上了。
商家军雇佣兵团的战斗力虽然强悍，但在清军几乎是两败俱伤的奋力战斗下，竟然也难以在取得突破，商家军连