弗朗西斯科的行踪其实是被他自己主动透露出来的。
马尼拉城破之后，弗朗西斯科在阿诺基三世的保护下，逃到了邦班牙族的居地，然后和阿诺基三世联名，传信到吕宋岛各地去，招号散布在吕宋岛的传教士一起发动圣战，维护天主教的光荣，让他们鼓动信仰天主教的土著们，共同抵抗中华军的的侵略。
但奥古斯丁会的传教士基本在马尼拉城里被中华军一网打尽，逃出去的人不多，在吕宋岛其他地区的传教士甚本都是方济各会或多明我会的传教士，对大主教的命令，并沒有奧古斯丁会那样奉若神明，另外也有不少传教士都十分清醒，连马尼拉城都被中华军占领了，西班牙军也全军覆没，靠当地的土著又能成什么事，抵抗只能是自取灭亡，还不如不抵抗，和中华军的几名传教士联糸，看看能不能有别的办法。因此响应大主教号招的人并不多
而就在这时，耶稣会的传教士也开始在吕宋岛活动，向各个土著部落，以及在部落里的传教士说明，与中华军作对只是死路一条，投降才能获得生路。中华军可以保证对土著部落不予追究，而其他的传教士只会被驱逐出吕宋群岛地区，也不会伤亡他们。但如果执意要和中华军做对，等待他们的只是死路一条，甚致是灭族之祸